由于石斛组培苗是非自然繁殖培育出来的，所以定植的时候要格外注意。温度过高或过低都不利于石斛苗的成活，所以在选择移栽时间时，一定要避免冬季移栽，最好也不要在夏季移栽。不过，由于不同地区不同季节的温度有差别，所以在选择移栽季节时可根据当地的具体情况来选择。
石斛定植前组培苗在驯化20~25天，且根长至0.5~1.0厘米时就可以移栽了，移栽前需洗净苗上的培养基，防止移栽后培养基腐烂导致烂根，还要用消毒液进行消毒。
然后按照一定的株距、行距在栽种的基质上挖出2~3厘米深的小洞，将处理好的组培苗2~3株一起放入小洞，让根部自然伸展，以基质刚好盖住根据为宜，然后浇水。
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