由于石斛最佳采收期为每年11月至第二年3月为佳。这是因为这个时期的石斛茎条进入成熟期，新茎增粗叶片不再增加。内光合作用的效果不是很强，富含的氨基酸、维生素和多糖都处于一年中最高，这些药用成分堆积在茎条内，这个时候采摘的石斛茎杆是最合适药用的，它们所具有的药效会比其他时间段里采摘的效果好。
采收石斛通常在秋末至春初，（每年11 月之次年3 进行。秋季石斛的新茎逐渐成熟，生长减慢，叶片发黄掉落，植株逐渐进入休眠期，待叶片落光或偶尔茎尖还留有1～2 片叶子的时候要适时采收，采收 时用剪刀剪切枝条，剪刀要快，剪口要平，以减少养分散失和利于伤口愈合， 特别注意茎基部要留下2~3 个节，以利于植株越冬来年新芽萌芽时养分供给。
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