金钗石斛栽培2～3年后一年四季均可采收，但以立冬至清明前植株未萌芽收获的为最佳，用剪刀从茎基部1cm处将生长2年以上并且叶片基本脱落完的老熟植株剪下来，留下嫩的植株，让其继续生长，加强管理，来年再采，达到一年栽种，多年受益的目的。
使用与金钗石斛不发生化学污染的洁净采收和运输工具及存放用具和采收机械进行采收。进一步除去金钗石斛采收时应除去的非药用部分，以及混入的其他植物和杂质等。金钗石斛采收要边采边放入田间运输工具，松紧适度，不得压紧。在规定时间内把采收的金钗石斛运送到初加工场所，避免在运输过程中与其他有毒物混合装运。
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